在婴幼儿中，最常见的引起腹泻的原因是感染病毒（诺如病毒、轮状病毒），此类病毒易在人群之间传染。由于公共卫生的改进，如清洁饮用水、合理处置污水等，细菌感染和寄生虫感染引起的腹泻的频率逐渐下降。除此之外，腹泻也可能由下面这些原因引起：
1.食物中毒（误食不恰当的蘑菇、贝类或被污染的食物）。
2.口服药物的副作用（大部分为抗生素）。
3.牛奶等食物过敏。
4.胃肠道外感染，包括尿路感染、呼吸系统感染，甚至中耳感染（如果孩子正在为治疗这些感染而服用抗生素药物，腹泻有可能更加严重）。
5.饮用果汁及甜饮料。