北京大学医院体检设备和仪器先进雄厚，现有PHILIPS彩色超声诊断仪、GE超声诊断仪、美国十二导心电图机、FX-3010福田心电图机、1.5T核磁共振成像机(MR)、64排螺旋CT机、数字化全身X光机（DR）、数字减影血管造影仪(DSA)，钼靶乳腺X光机、全自动血液分析仪、VRISYS2400全自动尿液分析仪、SysmexVF-500i全自动尿沉渣分析仪、AXSYM全自动化学发光分析仪、日本全自动生化分析仪、全自动糖化血红蛋白分析仪、全自动血流变分析仪、流式荧光免疫分析仪、骨密度检测仪、数字化非接触性眼压检测仪等。医院全部实行了计算机信息化管理。进一步提高了体检质量。